Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TOP3AQ13472 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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