Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE3BQ13370 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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