Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP3B2Q13367 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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