Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CBX3Q13185 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX3Q13185 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms