Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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