Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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CHAF1BQ13112 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CHAF1BQ13112 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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