Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FOXF2Q12947 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FOXF2Q12947 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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FOXF2Q12947 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXF2Q12947 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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