Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms