Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC15Q0P6D6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC15Q0P6D6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms