Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPP3CAQ08209 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms