Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms