Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL9Q07325 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXCL9Q07325 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms