Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LTBQ06643 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LTBQ06643 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LTBQ06643 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LTBQ06643 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBQ06643 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms