Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NHLH2Q02577 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms