Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FANCCQ00597 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCCQ00597 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms