Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK16Q00536 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms