Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFAMQ00059 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFAMQ00059 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms