Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CCL20P78556 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL20P78556 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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