Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRX1P78414 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRX1P78414 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRX1P78414 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRX1P78414 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms