Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113P62684 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms