Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB11AP62491 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms