Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP4BP1P59074 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP4BP1P59074 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms