Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LOXL3P58215 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LOXL3P58215 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms