Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIK1P57059 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIK1P57059 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms