Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNTBP49356 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FNTBP49356 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FNTBP49356 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FNTBP49356 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FNTBP49356 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FNTBP49356 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms