Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ME1P48163 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ME1P48163 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ME1P48163 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms