Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CAPZBP47756 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms