Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHKA1P46020 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms