Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ZEB1P37275 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZEB1P37275 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms