Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP62P37198 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms