Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHI3L1P36222 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms