Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NF2P35240 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NF2P35240 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NF2P35240 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NF2P35240 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NF2P35240 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NF2P35240 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NF2P35240 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms