Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA13P31271 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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