Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MARCKSP29966 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms