Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CD34P28906 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD34P28906 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD34P28906 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD34P28906 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD34P28906 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms