Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FGFR3P22607 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms