Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSMB1P20618 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms