Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNA2P20248 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNA2P20248 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms