Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB4P16144 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB4P16144 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms