Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCL2P13500 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCL2P13500 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms