Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNB1P11230 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms