Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HSP90AB1P08238 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms