Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOC3P02656 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC3P02656 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC3P02656 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC3P02656 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms