Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24BO95487 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms