Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOL3O95236 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOL3O95236 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOL3O95236 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL3O95236 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL3O95236 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL3O95236 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL3O95236 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOL3O95236 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOL3O95236 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL3O95236 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL3O95236 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL3O95236 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOL3O95236 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms