Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms