Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ABCC9O60706 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ABCC9O60706 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms