Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CUBNO60494 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUBNO60494 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUBNO60494 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms