Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DHX16O60231 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DHX16O60231 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms