Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SSNA1O43805 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms